Welcome to the Liu Lab
We are a computational biology and bioinformatics research group at the Inner Mongolia University of Science and Technology. Our aim is to explore and understand the biological questions in following three aspects: (i) epigenetic regulation in meiotic recombination; (ii) metabolic reprogramming in cancer;(iii) Modeling chromatin structure. In parallel, we are also interested in developing models or methods to better interpret omics data and further gain biological insights (see Research).
We are part of the Inner Mongolia University of Science and Technology Key Laboratory of Functional Genome Bioinformatics , which is located in Baotou, a city is famous for rare earth and deers in Inner Monglia Autonomous Regionn, China.
We are looking for new graduate students and undergraduate students to join the team (more info) !
刘国庆，博士，教授。于2004至2009年就读于内蒙古大学获得理论生物物理专业博士学位。2015至2016年在美国佐治亚大学生物化学与分子生物学系做访问学者，2019年至2020在北京大学生命科学学院做访问学者。目前任职于内蒙古科技大学生命科学与技术学院生物信息学系。内蒙古自治区“草原英才”，内蒙古自治区“321 人才工程”二层次人选，包头市“鹿城英才”，内蒙古生物工程学会常务理事(生物信息学专业委员会主任)，从事生物信息学，表观遗传学领域教学和研究。
研究方向
(i) 减数分裂重组的分子机制减数分裂重组是指真核细胞减数分裂过程中同源染色体之间遗传物质的交换，它是遗传多样性的重要 源泉，是有性生殖生物适应性进化的原动力，也是直接关系染色体非整倍体遗传疾病的过程。减数分裂重 组是 DNA 序列、染色质结构、组蛋白修饰、多种重组相关酶共同作用的复杂生物学过程。课题组关注重 组发生的分子机理:关注 DNA 序列信息、DNA 甲基化、核小体定位、组蛋白修饰、染色质可及性等表观 遗传信息对重组过程的调控，关注:(1)重组过程中染色质结构、表观遗传信号、三维基因组的动态变化 规律;(2)重组过程中基因表达调控网路;(3)重组冷热点的机器学习预测模型;(4)重组作用下的基因 组进化规律。
(ii) 肿瘤代谢重编程 肿瘤的发生与发展与多种因素有关，在分子水平上，除了基因突变、染色质表观修饰和结构变化等因 素外，肿瘤的代谢异常被认为是肿瘤发生和发展的重要推动力。肿瘤的糖代谢、脂质代谢和氨基酸代谢与 癌旁组织差异迥然。课题组关注肿瘤代谢相关基因的表达(转录组数据分析)，关注肿瘤代谢异质性，关注 肿瘤发生发展过程中代谢途径的动态变化规律。
(iii) 染色质结构建模真核生物的染色质有多层次结构:DNA 双螺旋缠绕组蛋白八聚体形成核小体结构单元，核小体串珠进 一步堆叠成直径约 30nm 的结构，在进一步折叠成环结构，细胞分裂中期形成最致密结构。染色质的包装 规律或原则调控基因转录、染色体复制、染色体重组等重要生物学过程，从而影响细胞分化与个体发育过 程。课题组关注核小体定位和滑动规则、30nm 结构的数理建模、基于 Hi-C 图谱的染色质高级结构建模。